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直属中国农业科学院领导。现有6个职能部门、4个研究中心、2个支撑部门、1个所办企业。
及时发布研究所发展重大事件、科研动态、国际国内合作动态、农业环保成果推广动态等，保障农业环保科研和成果最新动态呈现。
致力于解决农业和农村环境问题，开展关键技术攻关、基础与应用基础研究。
坚持人才优先战略，不断吸引优秀农业环保科技人才，造就一支学科专业较齐全、高层次人才集中、人员结构优化科技人才队伍。
利用国内外科技资源作为合作重点，积极组织重大国际、国内合作项目，开展富有成效的国际、国内交流与合作。
目前共有博士生导师14名，硕士生导师49名，在所研究生约160人（含留学生）。
完善科技基础条件平台、打造农业环保科研信息网络和系统，为研究所、中国农业科学院及全国农业环保科技创新工作提供强有力支撑。
认真贯彻党中央各项方针政策，加强精神文明与创新文化建设，党建与科研相结合促进农业环保科技事业发展。
